MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanolobus psychrophilus R15 chromosome

Total Repeats: 9912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018876	CAAG	2	8	22	29	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018876	CTT	2	6	479	484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018876	ATAA	2	8	543	550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018876	TTAA	2	8	1672	1679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018876	CGT	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018876	GTT	2	6	1828	1833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018876	ACT	2	6	1879	1884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018876	TGCC	2	8	1902	1909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_018876	AAT	2	6	1963	1968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018876	TTCT	2	8	1978	1985	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018876	TTC	2	6	2020	2025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018876	AC	3	6	2032	2037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_018876	TAC	2	6	2064	2069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_018876	ATG	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018876	TAT	2	6	2240	2245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018876	T	6	6	2291	2296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018876	ATT	2	6	2320	2325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018876	GA	3	6	2356	2361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018876	GAAGG	2	10	2367	2376	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018876	ATC	2	6	2801	2806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018876	A	6	6	2832	2837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018876	GTTGA	2	10	2855	2864	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018876	AT	3	6	2956	2961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018876	ATATA	2	10	3663	3672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018876	TA	4	8	3669	3676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018876	CCT	2	6	4511	4516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_018876	AAT	2	6	5461	5466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018876	GTA	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018876	ATTA	2	8	6356	6363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018876	AGT	2	6	6368	6373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018876	CAG	2	6	6412	6417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_018876	A	6	6	6478	6483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018876	TA	3	6	6485	6490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018876	CAA	2	6	6572	6577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018876	T	6	6	7039	7044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018876	TTTG	2	8	7073	7080	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018876	GTA	2	6	7655	7660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018876	CTTC	2	8	8118	8125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018876	TAAA	2	8	8126	8133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018876	GATA	2	8	8170	8177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018876	AAT	2	6	8209	8214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018876	ATTTA	2	10	8240	8249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018876	AAG	2	6	8312	8317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018876	TGT	2	6	8348	8353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018876	TCAC	2	8	8359	8366	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018876	TGC	2	6	8392	8397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018876	TTG	2	6	8401	8406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018876	AGG	2	6	8433	8438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018876	C	6	6	8458	8463	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_018876	GCAG	2	8	8841	8848	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018876	ACC	2	6	9014	9019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_018876	AATCC	2	10	9051	9060	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_018876	GCC	2	6	9064	9069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018876	CAATAC	2	12	9138	9149	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018876	TTG	2	6	9152	9157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018876	TC	3	6	9182	9187	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018876	AGG	2	6	9271	9276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018876	ACA	2	6	9509	9514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018876	CAAGA	2	10	9521	9530	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018876	GAA	2	6	9566	9571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018876	CGA	2	6	9648	9653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018876	TGA	2	6	9744	9749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018876	AGA	2	6	11783	11788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018876	AAT	2	6	11833	11838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018876	AGG	2	6	11902	11907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018876	TAT	2	6	11917	11922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018876	GT	3	6	12031	12036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018876	TGA	2	6	12094	12099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018876	CCT	2	6	12103	12108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018876	ATC	2	6	12119	12124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018876	TCT	2	6	12150	12155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018876	TGA	2	6	12201	12206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018876	GGA	2	6	12210	12215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018876	TCA	2	6	12291	12296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018876	CGATAC	2	12	12336	12347	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018876	TGG	2	6	12358	12363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018876	TCG	2	6	12433	12438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018876	ATAAG	2	10	12481	12490	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018876	GTA	2	6	12507	12512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018876	GAA	2	6	12554	12559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018876	TCC	2	6	12591	12596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_018876	AGG	2	6	12617	12622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018876	CTA	2	6	13489	13494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018876	AAT	2	6	13506	13511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018876	TCT	2	6	13512	13517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018876	AAT	2	6	13532	13537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018876	TA	3	6	13554	13559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018876	ACT	2	6	13582	13587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018876	AT	3	6	14902	14907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018876	T	7	7	14910	14916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018876	TCT	2	6	15006	15011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018876	AAT	2	6	15039	15044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018876	CCCTT	2	10	15094	15103	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_018876	CAC	2	6	15113	15118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_018876	TGC	2	6	15139	15144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018876	TCTTT	2	10	15194	15203	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_018876	ATA	2	6	15291	15296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018876	ATTA	2	8	15313	15320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018876	GAAG	2	8	15369	15376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018876	TGA	2	6	15468	15473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018876	A	6	6	16465	16470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018876	CAA	2	6	16737	16742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018876	AAC	2	6	16763	16768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018876	CTCC	2	8	18996	19003	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_018876	T	8	8	19125	19132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018876	CAGA	2	8	19172	19179	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_018876	ATT	2	6	19244	19249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018876	AGA	2	6	19337	19342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018876	CAG	2	6	19388	19393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018876	ATG	2	6	19910	19915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018876	TTC	2	6	19916	19921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018876	ATC	2	6	19928	19933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018876	GGTT	2	8	19934	19941	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018876	ATT	2	6	19958	19963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018876	TAA	2	6	19968	19973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018876	TTC	2	6	19975	19980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018876	ATC	2	6	20004	20009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_018876	TCCC	2	8	20083	20090	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_018876	GGAT	2	8	20096	20103	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018876	ATA	2	6	20116	20121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018876	ATC	2	6	20132	20137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018876	ATC	2	6	20208	20213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_018876	AG	3	6	20223	20228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018876	ATT	2	6	23651	23656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018876	AT	3	6	23844	23849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018876	TGG	2	6	24836	24841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018876	ATA	2	6	24842	24847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018876	AT	3	6	24858	24863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018876	GCA	2	6	24891	24896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018876	TAT	2	6	24911	24916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018876	GTTC	2	8	24919	24926	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018876	GTC	2	6	24933	24938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018876	TATT	2	8	28646	28653	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018876	ATG	2	6	28688	28693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018876	TA	3	6	28742	28747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018876	ATG	2	6	28811	28816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018876	TC	3	6	28921	28926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018876	CT	3	6	28939	28944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018876	CTC	2	6	28958	28963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_018876	T	6	6	29030	29035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018876	TA	3	6	29058	29063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018876	GGT	2	6	29068	29073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018876	AT	3	6	29091	29096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018876	ATC	2	6	29201	29206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018876	ATCAA	2	10	29219	29228	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_018876	TGC	2	6	29262	29267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_018876	TCT	2	6	29323	29328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_018876	CATT	2	8	29331	29338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018876	CGA	2	6	29360	29365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_018876	A	6	6	37738	37743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_018876	ATT	2	6	139924	139929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
488	NC_018876	AG	3	6	139972	139977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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